• Le mot du responsable d'Unité

    Notre unité de recherche regroupe plusieurs équipes/groupes implantés sur plusieurs sites hospitalo-universitaires Strasbourgeois. L'objectif global de l'Unité est de contribuer - en employant les techniques modernes de biologie cellulaire et moléculaire, génomique, et autres approches à haut-débit - à une meilleure compréhension des pathologies immunitaires/inflammatoires et cancéreuses. L'Unité, mixte INSERM-Université de Strasbourg, est structurellement liée au LabEx Transplantex, au laboratoire international associé INSERM FJ-HLA (Franco-Japonais) expert en séquençage à haut débit des gènes HLA et à la Fédération Hospitalo-Universitaire OMICARE, centré sur une approche multi-omique des pathologies immunitaires. Par ailleurs, la plateforme de génoséquençage GENOMAX fait partie intégrante de l'Unité. L'Unité a été à l'origine de l'essaimage de plusieurs sociétés innovantes (start-up). Professeur Seiamak BAHRAM, Directeur UMR_S 1109.

Historique et composition de l'équipe actuelle IMR

L'équipe actuelle a été crée en 2012, il s’agit d'une fusion entre deux équipes dont l’une était dirigée par le Pr Seiamak BAHRAM et l’autre par les Pr Jean SIBILIA et Dominique WACHSMANN.

Notre équipe est spécialisée dans les études génétique, épigénétique, du microenvironnement et dans la génération d’anticorps  dans le cadre des maladies auto-immunes, auto-inflammatoires et les greffes. Pour ce travail nous réunissons les meilleurs scientifiques/cliniciens reconnus au niveau national et international dans le domaine de la recherche fondamentale et translationnelle.

Nous possédons également une plateforme de séquençage à haut débit, ainsi qu’une start-up (Biomica) qui est spécialisée dans la génération de nouveaux  anticorps.

Au 1er janvier 2014 le Pr Samira Fafi-Kremer, les Dr Heidi Barth et Christine MOOG, virologues, ont rejoint notre unité avec leur équipe. Ils s’intéressent aux anticorps neutralisants le virus HIV et au rôle du BK virus dans les greffes. Notre équipe se trouve ainsi renforcée dans les domaines de la transplantation et du microenvironnement.

L’équipe a obtenu un LabEx (laboratoire d’excellence), nommé TRANSPLANTEX, sélectionné par la Ministère de l'Enseignement supérieur et de la recherche dont le budget s’élève à 5,5 million euros pour une période de 8 ans.

Ce consortium rassemble dix partenaires dont l’objectif est d’identifier des nouveaux loci d'histocompatibilité et de biomarqueurs impliqués dans le rejet de greffe qui conduira à  l'amélioration du diagnostic et des traitements.

L’équipe faite également partie de la Fédération Hospitalo Universitaire OMICARE, fondée et dirigée par le Pr Seiamak Bahram, ce projet est consacré aux maladies auto-immunes et inflammatoires qui représentent un enjeu majeur de santé publique. Il rassemble près de 400 chercheurs hospitalo-universitaires et universitaires et plusieurs industriels et start-up alsaciennes et internationaux sont partenaires de ce projet.

Nos recherches sont également financées par l’ANR, l’Inserm, l’Université de Strasbourg et par des associations telles que l’ARC.

 

 

 

Nos financements

Labex Transplantex (ANR), PRTS Spirale (ANR), ITMO Cancer (INSERM), ARC, Canceropôle Grand-Est (Lymphoseq), Contrat Européen 7eme PCRD, ANRS, SIDACTION, Fonds Pierre Bergé, LabEx Vaccine Research Institute, API HUS, PSTIC (DGOS)

 

Thérapies Ciblées du Microenvironnement Tumoral

Une tumeur est caractérisée par la communication existant entre les cellules tumorales et leur microenvironnement comprenant une matrice extracellulaire, des cellules stromales et des facteurs solubles qui vont déterminer. La ténascine-C (TNC) est une molécule spécifique de la matrice extracellulaire tumorale dont la forte expression est corrélée avec l'agressivité tumorale. Les laminines sont des constituants des lames basales, structures ayant une fonction de barrière mais dont l'expression aberrante dans les tissus cancéreux stimule l'angiogenèse et la croissance tumorale. Les stimulis extracellulaires comme les facteurs de croissance mais également les contraintes bio-mécaniques imposées par la matrice extracellulaire vont agir au niveau de la cellule, via des récepteurs membranaires tels les intégrines et la neuropiline-1, conduisant à l'activation de signaux intracellulaires qui vont modifier l'expression de gènes et le comportement des cellules.

Les projets sont organisés en 3 axes fortement interconnectés dirigés par G. Orend (la matrice extracellulaire comme niche), J. Goetz (biomécanique et imagerie) et D. Bagnard (peptides thérapeutiques ciblant la membrane cellulaire). Nous souhaitons comprendre comment des signaux externes comme une matrice extracellulaire riche en TNC sont interprétés par les cellules pour favoriser l'angiogenèse tumorale et les métastases. Nous voulons ensuite utiliser ces  connaissances pour développer de nouveaux moyens pour le diagnostic et le traitement du cancer mais également les combiner aux peptides thérapeutiques ciblant les domaines transmembranaires de récepteurs et ainsi bloquer la formation de métastases. Les objectifs sont les suivants: (1) pour mimer au plus près le cancer chez l'homme, développer des modèles tumoraux immunocompétents soit par sur-expression de la TNC ou des laminines ou par invalidation pour l'un ces gènes. (2) afin de définir le rôle de la TNC dans le "switch" angiogénique et la formation de métastases, en générant des modèles complémentaires d'angiogenèse in vivo, ex vivo et in vitro chez la souris, le poisson zèbre et le poulet et exprimant des niveaux variables de TNC. Ces modèles seront utilisés pour (3) déterminer les mécanismes d'action de nos nouveaux peptides transmembranaires et pour (4) imager en direct l'angiogenèse et la formation de métastases mais également analyser ces processus en utilisant l'imagerie corrélative en optique et en microscopie électronique combinée.

 Nanomédecine Régénérative 

Le projet "NanoRegMed" de notre équipe s'inscrit dans un programme visant une application clinique dans le domaine de la nano-médecine régénérative. Notre objectif est de permettre la régénération osseuse, cartilagineuse et dentaire. Pour cela, nous avons développé une stratégie innovante basée sur des d’implants dotés de nano réservoirs chargés de molécules à activité thérapeutique.

Brevets

1. CNRS, 2007: PCT/IB 2006/000378 du 28 janvier 2006 (N° publication: WO2006/079928): PCT Europe and US 2007.

2. INSERM/CNRS, 2009:JWO2007132099-A2; FR2901143-A1; WO2007132099-A3; EP2018194-A2;CA2652003-A1 ; US2009239302-A1.

3. INSERM / Université de Strasbourg, 2010 : PCT/IB2010/003458

4. INSERM / Université de Strasbourg, 2011/ BET 10P2884 Europe n°11305182.5

Nous sommes aussi à l’origine de la création de ARTiOS NanoMed, lauréat National du concours « émergence » d’aide à la création d’entreprises (Oséo et région) et lauréat du concours régional Conectus Alsace en 2011.

Site

http://www.regmed.fr/

Qui sommes-nous ?

GENOMAX est une plateforme de séquençage qui propose différents types de séquençage : Sanger et haut-débit (NGS : Séquençage Nouvelle Génération) pouvant ainsi répondre de manière efficace à vos projets de recherche.

De plus, GENOMAX est spécialisée dans différents domaines tels que :

  • Whole exome sequencing (capture Sure Select Agilent® ou Ampliseq® ThermoFisher)
  • RNA-seq (whole transcriptome et petits ARNs)
  • Méta-génomique
  • Séquençage ciblé (panels à façon par la méthode Ampliseq®)
  • Séquençage de gènes par la méthode de Sanger
  • Génotypage de SNPs

Pour se faire, nous disposons de plusieurs instruments :

  • SOLiD 5500 (ThermoFisher Scientific)
  • SOLiD 5500xl (ThermoFisher Scientific)
  • Ion PGM (ThermoFisher Scientific)
  • Ion Proton & Ion Chef (ThermoFisher Scientific)
  • NextSeq500 (Illumina)
  • ABI 3130xl 16 capillaires (ThermoFisher Scientific)
  • ABI 3730xl 96 capillaires (ThermoFisher Scientific)
  • ABI 7000 (PCR quantitative en temps réel)

Nous pouvons donc offrir une importante diversité de services de séquençage et  disposons de services complémentaires pour le contrôle et la préparation de vos échantillons, ainsi que pour les analyses bio-informatique. Nous sommes également ouverts à toute proposition de collaboration dans le cadre d’un projet de recherche.

N’hésitez pas à nous contacter afin d’étudier ensemble votre projet scientifique et établir la technologie la plus appropriée à vos besoins.

Contact : genomax@unistra.fr

 

 

Notre séquenceur  Ion PGM™                                                                  

Un de nos deux séquenceurs SOLiD®

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    Stages postdoctoraux

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    Master 2

    Des possibilités d’accueil en stage de Master 2 sont possibles dans l'équipe MN3T contact: gertraud.orend@inserm.fr ou jacky.goetz@inserm.fr

Ingénieur d'étude

Tél: +33 (0)3 88 27 77 27

Ingénieur d'étude Inserm

Tél: +33 (0)3 88 27 77 27

MCU Université de Strasbourg

Tél: +33(0)3 88 27 53 64

Chercheur Inserm

Tél: +33 (0)3 88 27 77 27

Doctorante Inserm

Tél: +33 (0)3 88 27 77 27

Master

Tél: +33 (0)3 88 27 77 27

secrétaire de direction Inserm

Tél: +33 (0)3 88 27 77 27

Assistant Ingénieur Inserm

Tél: +33 (0)3 88 27 53 57

CR1 Inserm

Tél: +33(0)3 67 15 11 90

Master Inserm

Tél: +33 (0)3 88 27 77 27

Doctorant Inserm

Tél: +33 (0)3 88 27 77 27

Doctorant Inserm

Tél: +33 (0)3 88 27 77 27

Chercheur Inserm

Tél: +33 (0)3 88 27 77 27

DR2 Inserm

Tél: +33(0)3 88 27 53 55

Doctorant Inserm

Tél: +33 (0)3 88 27 77 27

DR2 CNRS

Tél: +33(0)3 88 27 53 56

Post-doc Inserm

Tél: +33 (0)3 88 27 53 56

Doctorant Inserm

Tél: +33 (0)3 88 27 53 67

Ingénieur d'étude Inserm

Tél: +33 (0)3 88 27 77 27

Technicienne Inserm

Tél: +33 (0)3 88 27 77 27

Post-doc Inserm

Tél: +33 (0)3 88 27 77 27

17/01/2017

Crédits : Stéphane Marchand

De gauche à droite : Univ.-Prof. Hansjörg Schild (Immunologie, Universitätsmedizin Mainz), Prof. Dr. med. Caner Süsal (Transplantation rénale et HLA, Universitätsklinikum Heidelberg), Prof. Dr. med. Claudia Lengerke (Hématologie, Universitätsspital Basel), Prof. Dr. Robert Zeiser (Hématologie, Universitätsklinikum Freiburg), Caroline Debien (Unistra), Dr. Petya Apostolova (Hématologie, Universitätsklinikum Freiburg), Prof. Seiamak Bahram, Dr. Raphaël Carapito (Immunologie, Unistra)

Lundi 29 Septembre 2016

Nous avons le plaisir de vous inviter à la "journée pDC" (plasmacytoid 
dendritic cells in physiopathological mechanisms) organisée sous le 
patronat de la Fédération de Médecine Translationnelle (FMTS), programme 
"Immunologie-inflammation-infection" le Lundi 29 Septembre 2016, de 9:00 
h à 14:00 h à l'Amphi 301 du Forum de la Faculté de Médecine. 

Le site www.u1109.inserm.fr est une publication éditée par l'unité de recherche Inserm 1109,

Hôpitaux Universitaires de Strasbourg
Centre de Recherche d’Immunologie et d’Hématologie
4 rue Kirschleger
67085 Strasbourg Cedex
Téléphone : 03 68 85 39 92

Directeur de la publication : Seiamak Bahram, directeur de l'unité 1109.
Webmestre : Marguerite Jung (contacter le webmestre)
Hébergement : Tiz, agence referencement strasbourg

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En collaboration avec la Délégation régionale Grand-Est de l'Inserm et l'unité Inserm 1109.

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